Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Thbs3Q05895 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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