Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox10Q04888 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox10Q04888 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms