Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CkbQ04447 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CkbQ04447 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CkbQ04447 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CkbQ04447 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CkbQ04447 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CkbQ04447 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CkbQ04447 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CkbQ04447 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms