Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RelaQ04207 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms