Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ddr1Q03146 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms