Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gjb4Q02738 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb4Q02738 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms