Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pax5Q02650 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms