Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlh1Q02576 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlh1Q02576 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms