Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Muc1Q02496 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms