Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcd1Q02242 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms