Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RykQ01887 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RykQ01887 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RykQ01887 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RykQ01887 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RykQ01887 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms