Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd1Q01822 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms