Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1cQ01815 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms