Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nme2Q01768 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nme2Q01768 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nme2Q01768 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nme2Q01768 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms