Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec23aQ01405 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec23aQ01405 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms