Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col1a2Q01149 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms