Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde1bQ01065 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms