Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PrcdQ00LT2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms