Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbp4Q00724 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbp4Q00724 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms