Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apoa1Q00623 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apoa1Q00623 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms