Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gabpb1Q00420 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gabpb1Q00420 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms