Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn1bP97952 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn1bP97952 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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