Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VegfdP97946 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VegfdP97946 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms