Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AlkP97793 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AlkP97793 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AlkP97793 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AlkP97793 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AlkP97793 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AlkP97793 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AlkP97793 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AlkP97793 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AlkP97793 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AlkP97793 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AlkP97793 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AlkP97793 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AlkP97793 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AlkP97793 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AlkP97793 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms