Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
rp9P97762 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
rp9P97762 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
rp9P97762 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
rp9P97762 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
rp9P97762 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
rp9P97762 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
rp9P97762 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms