Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tarbp2P97473 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tarbp2P97473 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms