Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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