Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nbr1P97432 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms