Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms