Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx2P81066 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms