Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprn2P80560 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprn2P80560 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms