Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Otx2P80206 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms