Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Otx1P80205 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms