Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx3P70354 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx3P70354 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms