Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema3eP70275 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sema3eP70275 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms