Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd13P70217 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hoxd13P70217 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hoxd13P70217 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hoxd13P70217 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hoxd13P70217 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hoxd13P70217 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hoxd13P70217 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hoxd13P70217 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hoxd13P70217 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hoxd13P70217 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd13P70217 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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