Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tubb4bP68372 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms