Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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