Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tra2bP62996 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tra2bP62996 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tra2bP62996 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tra2bP62996 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tra2bP62996 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tra2bP62996 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tra2bP62996 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tra2bP62996 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms