Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vbp1P61759 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vbp1P61759 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vbp1P61759 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vbp1P61759 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Vbp1P61759 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vbp1P61759 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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