Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rin3P59729 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms