Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scarf2P59222 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scarf2P59222 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms