Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ctdsp1P58466 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms