Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bace1P56818 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms