Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lim2P56563 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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