Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5bP56480 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5bP56480 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms