Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CartptP56388 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CartptP56388 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CartptP56388 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CartptP56388 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms