Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nub1P54729 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nub1P54729 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nub1P54729 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nub1P54729 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nub1P54729 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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