Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad23aP54726 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rad23aP54726 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms