Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Dbx1P52950 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dbx1P52950 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dbx1P52950 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dbx1P52950 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dbx1P52950 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dbx1P52950 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dbx1P52950 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dbx1P52950 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dbx1P52950 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dbx1P52950 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dbx1P52950 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dbx1P52950 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Dbx1P52950 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Dbx1P52950 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Dbx1P52950 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Dbx1P52950 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dbx1P52950 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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